金匮肾气丸和桂附地黄丸的主要成分相同，均含有附子（制）、肉桂、熟地黄、山茱萸（制）、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻等中药，但在药物配比和功效上存在一定区别。
金匮肾气丸具有温补肾阳、化气行水的功效，主要用于治疗肾阳虚引起的腰膝酸软、畏寒肢冷、小便不利或反多、痰饮喘咳等病症。其药物组成中，附子和肉桂性热，可温补肾阳；地黄、山茱萸滋阴补肾；山药、茯苓健脾渗湿；泽泻、丹皮清热泻火。诸药合用，共奏温补肾阳、化气行水之功。
桂附地黄丸是在金匮肾气丸的基础上加了两味药，即车前子和牛膝。车前子清热利尿，可引热下行；牛膝补肝肾、强筋骨、活血通经。因此，桂附地黄丸的功效除了温补肾阳外，还可引火归元，适用于肾阳不足、腰膝酸冷、肢体浮肿、小便不利或反多、痰饮喘咳、消渴等病症。此外，桂附地黄丸还具有一定的降糖、降脂作用，对改善胰岛素抵抗有一定帮助。
需要注意的是，金匮肾气丸和桂附地黄丸均为处方药，应在医生的指导下合理使用。在服用这两种药物期间，应避免食用不易消化的食物；肾阳虚症状明显者，如腰膝冷痛、肢寒畏冷等，可适当多吃一些温热的食物，如羊肉、韭菜等；服用期间出现任何不适，应及时就医。