月经快干净时小腹隐痛，可能是以下原因引起：
1.残留在子宫内的经血流出不畅，刺激子宫收缩，从而引起疼痛。
2.月经快干净时，体内的前列腺素水平仍然较高，前列腺素会刺激子宫平滑肌收缩，引起下腹疼痛。
3.月经快干净时，身体抵抗力下降，此时如果不注意保暖，或吃了生冷、辛辣的食物，可能会导致盆腔血管收缩，从而引起下腹隐痛。
如果月经快干净时小腹隐痛症状较轻，一般不需要特殊处理，注意保暖，避免吃生冷、辛辣的食物，同时保持心情愉悦，避免过度劳累，多可自行缓解。如果小腹隐痛症状较严重，或持续时间较长，可能是其他疾病引起，如子宫内膜异位症、盆腔炎等，需要及时就医，明确病因后进行针对性治疗。