三个月小孩咳嗽有痰，可采取以下措施：
1.多次少量喂水：有助于稀释痰液，促进排出。
2.经常改变体位：可轻拍孩子背部，促进痰液松动，便于咳出。
3.保持室内空气湿润：使用加湿器等方法，增加空气湿度，减少对呼吸道黏膜的刺激。
4.及时就医：如果咳嗽加重、呼吸急促、发热等症状持续不缓解，应及时就医，在医生的指导下使用祛痰药物或进行其他治疗。
需要注意的是，不建议自行给孩子使用止咳药，因为咳嗽是身体的一种自我保护机制，有助于清除呼吸道内的痰液和异物。如果盲目止咳，可能会导致痰液堵塞呼吸道，加重病情。同时，要密切观察孩子的病情变化，如有异常应及时就医。