三个月小孩咳嗽有痰，可采取以下措施：
1.保持空气湿润：可以使用加湿器增加空气湿度，有助于缓解咳嗽和祛痰。
2.拍背排痰：让孩子侧卧或抱起侧卧，家长五指微曲成半环状，即空心拳，然后轻轻拍打孩子的前胸及侧胸背部，两侧交替进行，拍背力量不宜过大，由上而下，从外向内，依次进行。每侧拍3~5分钟，每天拍2~3次。
3.多喝温水：多喝水有助于稀释痰液，便于咳出。
4.及时就医：如果咳嗽和痰的症状持续加重或伴有其他不适，如呼吸急促、发热等，应及时就医。医生可能会根据具体情况给予药物治疗，如祛痰药、止咳药等。
需要注意的是，对于三个月大的婴儿，咳嗽有痰可能是多种原因引起的，如感冒、肺炎等。在处理时，应密切观察孩子的情况，如果症状加重或持续时间较长，应及时就医，以便明确病因并采取相应的治疗措施。同时，在就医过程中，应遵循医生的建议，按时给孩子服药，并注意孩子的护理和喂养。