肛门外长有小肉疙瘩并伴有疼痛，可能是多种肛肠疾病的症状，以下是一些可能的原因和建议：
1.外痔：肛门口有小肉疙瘩，伴有疼痛，可能是外痔。外痔位于齿状线以下，由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成。如果症状不严重，可以通过改善生活习惯来缓解，如保持肛门清洁、多吃膳食纤维、避免久坐等。如果症状严重，影响生活质量，可能需要手术治疗。
2.肛裂：肛门有小肉疙瘩，伴有疼痛、便血，可能是肛裂。肛裂是肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型症状是肛门疼痛、便血和便秘。早期肛裂可以通过坐浴、润便等保守治疗方法愈合。如果肛裂反复发作，形成慢性肛裂，可能需要手术治疗。
3.肛周脓肿：肛门周围出现红肿、疼痛的小肉疙瘩，可能是肛周脓肿。肛周脓肿是肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生的急性化脓性感染，形成的脓肿。肛周脓肿需要及时切开引流，否则可能会形成肛瘘。
4.肛管或直肠肿瘤：肛门外长有小肉疙瘩，伴有疼痛、出血、消瘦等症状，可能是肛管或直肠肿瘤。肛管或直肠肿瘤早期症状不明显，容易被忽视，中晚期可能会出现肠梗阻、贫血、体重下降等症状。如果有上述症状，需要及时就医，进行肛门指诊、结肠镜等检查，以明确诊断。
总之，肛门外长有小肉疙瘩并伴有疼痛的原因很多，需要根据具体情况进行分析和治疗。建议及时就医，避免自行用药，以免延误病情。