怀孕40天药流是否需要清宫，取决于药流后的具体情况。一般来说，以下几种情况需要考虑清宫：
1.药流后阴道流血时间长：药流后通常会有少量阴道流血，持续时间一般在1-2周左右。如果药流后阴道流血时间超过2周，或者流血量逐渐增多，伴有腹痛等不适，可能提示药流不全，需要进行清宫。
2.药流后宫腔内有残留物：药流后通过B超检查发现宫腔内有残留物，且残留物较大，直径超过2cm，也需要进行清宫。
3.药流失败：药流后孕囊没有排出，或者孕囊排出后阴道流血仍然较多，也需要进行清宫。
需要注意的是，药流有一定的失败率和残留率，如果药流后出现异常情况，应及时就医，医生会根据具体情况进行评估，并给出相应的治疗建议。
此外，药流也有一些注意事项：
1.药流必须在医生的指导下进行，严格按照医嘱用药。
2.药流前需要进行全面的身体检查，排除药流的禁忌证。
3.药流后需要注意休息，避免劳累和剧烈运动。
4.药流后需要密切观察阴道流血情况，如有异常及时就医。
5.药流后需要进行复查，了解子宫恢复情况。
总之，怀孕40天药流后是否需要清宫，需要根据个人情况而定。药流后应注意观察身体变化，如有异常及时就医，以便及时处理。同时，药流也有一定的风险，应在医生的指导下进行。