月经结束后的第三天进行性行为，怀孕的可能性较小，但不能完全排除怀孕的可能。以下是一些可能的情况：
1.安全期：一般来说，月经周期规律的女性，排卵日通常在下次月经来潮前的14天左右，排卵日及其前5天和后4天加在一起称为排卵期。除了排卵期和月经期，其他时间都属于安全期。月经结束后的第三天可能处于安全期，但安全期并非绝对安全，因为女性的排卵时间可能会受到情绪、环境等因素的影响而发生改变。
2.精子存活时间：精子在女性体内可能存活2-3天，如果在排卵期前的安全期内同房，精子可能会在女性体内等待卵子的排出，从而增加怀孕的机会。
3.月经周期不规律：有些女性的月经周期不规律，排卵时间也会相应改变，这就增加了怀孕的风险。
4.额外的排卵：极少数女性可能会出现额外的排卵，即使在安全期也有可能怀孕。
需要注意的是，每个人的身体状况和生理周期都有所不同，以上只是一般情况下的分析。如果您担心怀孕，可以考虑以下措施：
1.紧急避孕药：在同房后72小时内服用紧急避孕药，可以降低怀孕的风险，但紧急避孕药不能作为常规的避孕方法，且可能会引起月经紊乱等副作用。
2.验孕：如果您出现月经推迟、恶心、呕吐等怀孕症状，可以进行验孕测试，以确定是否怀孕。
3.咨询医生：如果您对怀孕的风险有疑虑，或者有其他健康问题，建议咨询医生，医生可以根据您的具体情况提供更准确的建议和指导。
此外，无论是否处于安全期，都应该采取适当的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等，以避免不必要的怀孕和性传播疾病的风险。同时，也要注意性健康和卫生，保护自己和他人的身体健康。