月经结束第三天同房有怀孕的可能，但相对较低。一般月经周期规律的女性，排卵期通常在下次月经前14天左右，月经结束第三天距离排卵期还有一段时间，此时卵巢排卵的可能性较小，怀孕概率相对低，但不是绝对不会怀孕，因为有些女性月经周期不规律，排卵时间可能提前或延后。
月经周期与排卵的关系
月经周期规律的情况： 对于月经周期为28 - 30天的女性，月经持续3 - 7天，月经结束第三天大约处于月经周期的第7 - 8天，这个时候卵泡还在发育阶段，排卵的可能性比较小，所以怀孕几率相对低。但如果月经周期较短，比如21天左右，月经结束第三天可能就接近排卵期了，怀孕风险会增加。月经周期不规律的情况： 有些女性月经周期紊乱，排卵时间不固定，可能会出现意外排卵的情况，那么在月经结束第三天同房就有怀孕的可能。比如有的女性因为生活压力大、环境改变等因素影响，排卵时间提前，就可能在月经结束第三天遇到排卵期，从而受孕。
怀孕的其他影响因素
精子存活时间： 精子在女性体内可以存活2 - 3天左右。如果月经结束第三天同房，精子进入女性体内后，有可能存活到排卵期，从而与卵子结合受孕。所以即使月经结束第三天不是排卵期，如果精子存活时间刚好赶上排卵，也会导致怀孕。卵子存活时间： 卵子排出后一般只能存活1 - 2天。如果月经结束第三天同房，精子及时进入女性体内，而卵子在之后的1 - 2天内排出，也有可能受精怀孕。不过相对来说，这种情况发生的概率比精子存活赶上排卵的概率要低一些。
避孕的建议
使用安全套： 如果没有怀孕计划，月经结束第三天同房也可以考虑使用安全套避孕，安全套不仅可以避孕，还能在一定程度上预防性传播疾病。监测排卵： 对于月经周期不规律的女性，可以通过基础体温测量、排卵试纸监测等方法来了解自己的排卵时间，从而更好地避开排卵期同房，降低怀孕风险。比如基础体温测量是每天早晨醒来后不活动时测量体温，排卵后基础体温会升高0.3 - 0.5℃；排卵试纸则是通过检测尿液中黄体生成素的峰值来预测排卵时间。