手掌骨头上长了硬疙瘩有点疼，可能是多种原因引起的，以下是一些可能的情况：
1.腱鞘囊肿：好发于手腕和手背，是一种良性肿瘤，通常是由于关节囊、韧带、腱鞘中的结缔组织退变所致。囊肿一般呈半球形，表面光滑，与皮肤无粘连，质地硬，有弹性，可有轻度压痛。
2.关节炎：如类风湿关节炎、骨关节炎等，可导致关节肿胀、疼痛、畸形等。手掌骨关节炎也可能引起手掌骨头处长硬疙瘩，并伴有疼痛。
3.感染：如细菌、病毒、真菌等感染，可引起手掌骨头发炎，出现红肿、热痛等症状。
4.外伤：手掌骨骨折、软组织损伤等，可能导致局部血肿、硬结，并伴有疼痛。
5.其他：手掌骨头上长硬疙瘩还可能与肿瘤、腱鞘炎、痛风等疾病有关。
如果手掌骨头上的硬疙瘩伴有疼痛，建议及时就医，进行详细的检查，如X光、CT、血常规、血沉、C反应蛋白、自身抗体等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
对于特殊人群，如孕妇、儿童、老年人等，由于身体状况不同，可能需要特殊的检查和治疗方案。此外，一些疾病可能需要长期治疗和随访，患者应遵医嘱按时服药、复查，以控制病情，防止并发症的发生。
总之，手掌骨头上长硬疙瘩有点疼可能是多种疾病的表现，需要引起重视。及时就医，明确诊断，采取合适的治疗方法，有助于缓解症状，促进康复。