手掌有个小疙瘩硬按压疼痛可能是由腱鞘囊肿、皮脂腺囊肿、脂肪瘤等疾病所导致，建议及时就医并完善相关检查，以明确具体原因。具体如下：
一、腱鞘囊肿：
1.形成原因：可能因软组织蜕变或长期受到刺激，致使局部结缔组织出现异常。
2.症状表现：会使患处有小疙瘩，伴有肿胀、疼痛，严重时还会引起活动受限。
二、皮脂腺囊肿：
1.引发因素：通常由毛囊皮脂腺堵塞所引起。
2.具体情况：可发生在身体任何部位，一般位于皮下且与皮肤组织紧密粘连，若伴有细菌感染会导致局部红肿，按压时疼痛，呈现手掌有个小疙瘩硬按压疼痛的现象。
三、脂肪瘤：
1.产生原因：通常由遗传、全身脂代谢异常所导致。
2.相关症状：发生在四肢表皮下，局部出现小硬疙瘩，按压会疼痛，严重时也会引起如麻木等压迫症状。
此外，患者手掌出现该症状还可能与患有神经纤维瘤、寻常疣等疾病有关。总之，出现手掌有个小疙瘩硬按压疼痛的症状后应尽快就医检查，明确具体病因。