怀孕39周时，小腹出现类似来月经的疼痛，可能是以下原因引起：
1.假性宫缩：孕晚期可能会出现假性宫缩，其特点是宫缩持续时间短且不恒定，间歇时间长且不规律，宫缩强度不增加，常在夜间出现，清晨消失，这种宫缩不会使宫颈管消失和扩张。
2.胎儿下降：孕39周时，胎儿可能已经入盆，这可能会导致腹部坠胀感和疼痛，类似于来月经时的感觉。
3.临产：如果疼痛逐渐增强，间隔时间缩短，持续时间延长，同时伴有阴道见红、破水等症状，可能是临产的征兆，需要及时就医。
此外，孕妇应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，如果疼痛持续不缓解或伴有其他异常症状，如阴道流血、头晕、恶心等，应及时就医，进行详细的产前检查和评估，以确保孕妇和胎儿的安全。
需要注意的是，每个孕妇的情况都可能不同，如果对腹痛症状有任何疑虑或担忧，应及时咨询医生的意见。同时，孕妇应按时进行产前检查，以便及时发现和处理任何潜在的问题。