怀孕39周小腹有时疼像来月经，可能是以下原因：
1.假性宫缩：怀孕39周时，子宫会出现假性宫缩，这是一种正常的生理现象。假性宫缩的特点是宫缩时间短、间隔时间长且不规律，宫缩强度不会逐渐增强，通常不会引起宫颈管缩短和宫口扩张，对胎儿也没有不良影响。但如果假性宫缩过于频繁或伴有阴道流血、破水等症状，应及时就医。
2.胎儿下降：怀孕39周时，胎儿已经入盆，这可能会导致小腹坠胀、疼痛，类似于来月经的感觉。这种情况通常是正常的，但也需要注意观察，如果疼痛加剧或出现其他异常症状，应及时就医。
3.临产：如果小腹疼痛逐渐加剧，间隔时间越来越短，疼痛持续时间越来越长，同时伴有阴道见红、破水等症状，可能是临产的征兆。此时应立即就医，准备分娩。
需要注意的是，每个孕妇的情况都不同，如果出现小腹疼痛等异常症状，应及时就医，以便医生进行详细的检查和诊断，并给出相应的建议和治疗方案。同时，孕妇在孕期应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的心态，如有异常应及时就医。