宝宝发烧39度吃药不退，可采取以下措施：
1.物理降温：用温水擦拭宝宝的手心、腋窝、腹股沟等部位，或使用退热贴。
2.补充水分：让宝宝多喝水，以补充因发烧而流失的水分。
3.就医检查：如果宝宝发烧持续不退，或伴有其他症状，如咳嗽、呕吐、腹泻等，应及时就医，进行详细的检查，以确定病因，并在医生的指导下进行治疗。
4.避免捂汗：不要给宝宝穿过多的衣物或盖太厚的被子，以免影响散热。
5.注意观察：密切观察宝宝的体温、精神状态、呼吸等情况，如有异常，应及时就医。
此外，在日常生活中，家长应注意保持宝宝的个人卫生，勤洗手，避免带宝宝去人员密集的场所，注意室内通风，根据天气变化及时增减衣物，合理安排宝宝的饮食，保证营养均衡。