怀孕三个月偶尔肚子疼，可能是以下原因引起：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长发育。在这个过程中，子宫可能会出现牵拉、收缩等情况，从而引起肚子疼，但通常疼痛比较轻微，而且是阵发性的。
2.韧带牵拉：怀孕后，孕妇的身体会分泌一种叫做松弛素的激素，以帮助韧带和关节松弛，为分娩做准备。这种激素的分泌可能会导致腹部和腰部的韧带牵拉，引起疼痛。
3.胃肠道不适：怀孕后，孕妇的胃肠道功能可能会受到影响，容易出现消化不良、胃胀、胃痛等症状，从而引起肚子疼。
4.其他原因：怀孕三个月时，胎儿已经比较稳定，但仍可能出现一些其他问题，如先兆流产、宫外孕、子宫肌瘤等，这些情况也可能导致肚子疼。
如果怀孕三个月偶尔肚子疼，但是没有阴道流血、腰酸等其他不适症状，可以先观察一下。如果疼痛持续时间较长、程度较重，或者伴有其他不适症状，如阴道流血、腰酸、下坠感等，应及时就医，进行相关检查，如B超、孕酮、HCG等，以排除先兆流产、宫外孕等异常情况。
此外，在怀孕期间，孕妇应注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的心态，避免紧张、焦虑等不良情绪。同时，应注意饮食卫生，避免食用辛辣、刺激性食物，多吃新鲜的蔬菜和水果，保持大便通畅。如果有任何不适症状，应及时就医，以便早期发现和处理问题。