来月经时小便疼，可能是以下原因引起：
1.经期卫生不良：月经期间，子宫内膜脱落，宫腔有创面，阴道酸碱度改变，防御功能下降，如果不注意个人卫生，使用不洁卫生巾或卫生纸，或有性生活，就容易导致病原体入侵，引起炎症，出现尿痛。
2.尿道炎：尿道炎是泌尿系统最常见的疾病。女性尿道口与阴道口和肛门相邻，容易被阴道分泌物及粪便污染，加上女性尿道较短而宽，远段又较直，因此细菌容易上行感染，引起尿道炎。尿道炎可表现为尿频、尿急、尿痛，有时还可伴有血尿。
3.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，主要由细菌感染引起。膀胱炎的症状与尿道炎相似，也可表现为尿频、尿急、尿痛，有时还会出现下腹疼痛、血尿等。
4.阴道炎：阴道炎是阴道的炎症，常见的有霉菌性阴道炎、滴虫性阴道炎、细菌性阴道炎等。阴道炎可引起阴道分泌物增多，分泌物刺激尿道口，也可能导致尿痛。
5.其他：泌尿系统结石、肿瘤等也可能导致小便疼。
如果来月经时出现小便疼，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、白带常规、泌尿系统超声等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，要注意个人卫生，保持外阴清洁，多喝水，勤排尿，避免憋尿。在治疗期间，应避免性生活，以免加重病情。