脖子两侧肌肉疼了两天，可能与以下原因有关：
1.落枕：如果睡眠时姿势不良、枕头过高或过低，可能导致脖子两侧肌肉长时间处于紧张状态，引起疼痛。此外，颈部受凉也可能诱发落枕。
2.颈部肌肉劳损：长期低头工作、学习，或颈部保持同一姿势时间过长，可导致颈部肌肉劳损，引起疼痛。
3.颈部外伤：如颈部受到外力撞击、扭伤等，可导致颈部肌肉损伤，引起疼痛。
4.颈椎病：颈椎间盘退行性改变可导致颈部神经根受压，引起颈部及上肢疼痛、麻木等症状。
5.感染：如颈部淋巴结炎、扁桃体炎等感染性疾病，可导致颈部肌肉疼痛。
6.其他：甲状腺疾病、心脏疾病等也可能引起颈部疼痛。
如果脖子两侧肌肉疼痛持续不缓解，或伴有上肢麻木、无力、头晕等症状，建议及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。同时，可采取以下措施缓解疼痛：
1.休息：避免长时间低头或仰头，减少颈部活动。
2.热敷：用热毛巾或热水袋热敷颈部，每次20-30分钟，每天数次。
3.按摩：轻轻按摩颈部肌肉，缓解肌肉紧张。
4.药物治疗：可口服非甾体类抗炎药（如布洛芬、对乙酰氨基酚等）缓解疼痛。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果疼痛症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以免延误病情。