三个月大的宝宝肚子胀气不消化，可能是由于以下原因：
1.喂奶方式不当：宝宝吃奶过多或奶嘴孔径过大，导致吸入过多空气；或喂奶后频繁改变体位，导致奶液反流，引起腹胀。
2.消化不良：宝宝的消化系统尚未发育成熟，容易出现消化不良的情况。如果宝宝吃了过多难以消化的食物，或食物在肠道内过度发酵，就会产生气体，导致腹胀。
3.腹部受凉：宝宝的腹部如果受凉，也会导致胃肠道蠕动减慢，使食物在肠道内过度发酵，产生气体，引起腹胀。
4.肠道菌群失调：宝宝的肠道内有益菌数量较少，有害菌数量较多，会导致肠道菌群失调，使食物在肠道内发酵，产生气体，引起腹胀。
5.其他：如果宝宝患有某些疾病，如先天性巨结肠、肠梗阻等，也会导致肚子胀气不消化。
针对宝宝肚子胀气不消化的情况，可以采取以下措施：
1.调整喂奶方式：喂奶时要注意控制奶量和奶嘴孔径，避免宝宝吸入过多空气；喂奶后要及时拍嗝，帮助宝宝排出胃内气体。
2.按摩腹部：以宝宝的肚脐为中心，顺时针按摩腹部，促进胃肠道蠕动，帮助排气。
3.腹部热敷：用热水袋或热毛巾热敷宝宝的腹部，但要注意温度不宜过高，以免烫伤宝宝。
4.服用益生菌：益生菌可以调节肠道菌群，促进消化吸收，缓解腹胀。可以在医生的指导下，给宝宝服用益生菌。
5.就医治疗：如果宝宝的腹胀症状持续不缓解，或伴有呕吐、腹泻、发热等其他症状，可能是患有其他疾病，需要及时就医治疗。
需要注意的是，在给宝宝治疗的同时，家长还应注意调整宝宝的饮食，避免给宝宝吃过多难以消化的食物，如肉类、豆类等。同时，要注意宝宝的腹部保暖，避免着凉。如果宝宝是母乳喂养，妈妈也要注意自己的饮食，避免吃辛辣、油腻、刺激性的食物，以免影响宝宝的消化。