手掌肉里面长硬疙瘩按压疼痛，可能是以下原因导致的：
1.寻常疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，可通过直接或间接接触传播。HPV感染皮肤黏膜后，会在局部增殖，形成赘生物，即寻常疣。寻常疣通常表现为质地较硬、表面粗糙的丘疹，可逐渐增大，有时会伴有疼痛或瘙痒。
2.鸡眼：由于长期受压或摩擦，导致皮肤角质层增厚。鸡眼通常好发于足底、足趾等部位，也可出现在手掌。鸡眼呈圆锥形，尖端向内嵌入真皮，压迫神经末梢，引起疼痛。
3.胼胝：长期机械刺激引起的角质层增厚，好发于手掌、足跟等部位。一般无明显症状，当受到压迫时可能会出现疼痛。
4.其他：手掌肉里面长硬疙瘩按压疼痛还可能是其他原因引起的，如皮肤纤维瘤、腱鞘囊肿、脂肪瘤等。
针对不同的病因，治疗方法也有所不同。以下是一些常见的治疗方法：
1.寻常疣：可采用冷冻、激光、电灼等物理治疗方法，也可外用药物治疗，如咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等。
2.鸡眼：可使用鸡眼贴、水杨酸软膏等药物治疗，也可采用鸡眼挖除术等手术治疗方法。
3.胼胝：一般不需要特殊治疗，可通过减少局部刺激、穿宽松的鞋子等方式缓解症状。
4.其他：较小的肿物可通过观察或定期复查，较大的肿物可采用手术切除等方法治疗。
如果手掌肉里面长硬疙瘩按压疼痛，建议及时就医，明确诊断后，在医生的指导下进行治疗。同时，要注意避免搔抓、挤压肿物，以免加重病情。