半夜肛门胀痛疼醒可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，可导致肛门疼痛、出血和便秘。饮酒、吃辛辣食物等可加重症状。可使用硝酸甘油软膏、利多卡因凝胶等药物，也可口服乳果糖等药物缓解便秘。若症状严重，需手术治疗。
2.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，可表现为肛门疼痛、肿胀、发热等。需使用抗生素控制感染，如头孢呋辛酯、阿莫西林等。脓肿形成后，需切开引流。
3.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦部的炎症，可引起肛门坠胀、疼痛等不适。可使用高锰酸钾溶液坐浴，缓解症状。也可口服抗生素，如甲硝唑、左氧氟沙星等。
4.痔疮：内痔或混合痔脱出、嵌顿，可引起肛门疼痛。可使用痔疮膏、痔疮栓等药物治疗。严重者需手术治疗。
5.其他：直肠炎、肛管炎、直肠癌等也可引起肛门疼痛。
如果经常出现半夜肛门胀痛疼醒的情况，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。同时，要注意保持肛门局部清洁，避免久坐、久站，饮食宜清淡，多吃蔬菜水果，保持大便通畅。