口腔后面肉肿疼但不是牙疼，可能是下述原因引起：
1.智齿冠周炎：智齿（第三磨牙）萌出不全或阻生时，牙冠周围软组织发生的炎症。
病因：由于智齿萌出不全，牙冠部分被牙龈覆盖，形成盲袋，食物残渣容易在此堆积，滋生细菌。当身体抵抗力下降时，细菌就会大量繁殖，引起炎症。
原理：细菌感染导致牙龈红肿、疼痛，严重时还会化脓。炎症可能会扩散到周围组织，引起张口受限、吞咽疼痛等症状。
2.扁桃体炎：扁桃体的炎症。
病因：主要由细菌或病毒感染引起，如乙型溶血性链球菌、葡萄球菌、肺炎球菌等。此外，过度疲劳、抵抗力下降、有害气体刺激等也可导致扁桃体炎的发生。
原理：扁桃体受到感染后，会出现红肿、疼痛的症状，吞咽时疼痛加剧。严重时还会伴有高热、头痛、全身不适等症状。
3.口腔黏膜溃疡：口腔黏膜的溃疡性损伤。
病因：口腔溃疡的发生与多种因素有关，包括局部创伤、精神紧张、食物、药物、营养不良、激素水平改变及维生素或微量元素缺乏等。
原理：口腔溃疡通常表现为圆形或椭圆形的溃疡，表面覆盖有灰白色假膜，周围有红晕，灼痛感明显。溃疡一般具有自限性，可在7~10天自愈。
4.其他：口腔肿瘤、手足口病等也可能导致口腔后面肉肿疼。
治疗方法：
1.针对病因进行治疗：如智齿冠周炎需进行局部冲洗、上药，并在医生的指导下使用抗生素；扁桃体炎需使用抗生素进行治疗；口腔溃疡一般可自行愈合，可在医生的指导下使用口腔溃疡散、西瓜霜等药物。
2.对症治疗：疼痛明显时可使用布洛芬、对乙酰氨基酚等药物缓解疼痛。
3.注意口腔卫生：保持口腔清洁，勤漱口，避免食用辛辣、刺激性食物。
4.调整饮食：多吃富含维生素的蔬菜和水果，有助于促进溃疡愈合。
5.就医诊治：如果口腔后面肉肿疼的症状持续不缓解或加重，应及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果出现口腔后面肉肿疼的症状，建议及时就医，以便明确病因，采取针对性的治疗措施。