脚趾甲中间凹进去可能有以下原因：
1.营养不良：缺乏维生素、矿物质等营养物质可能导致指甲营养不良，出现凹陷。此外，缺铁性贫血、扁平苔藓等疾病也可能影响指甲的健康。
2.真菌感染：灰指甲（甲癣）是由真菌感染引起的，会导致指甲变厚、变色、凹陷等。如果同时伴有指甲发黄、增厚、易碎等症状，需要考虑真菌感染的可能。
3.外伤：脚趾甲受到外伤，如挤压、碰撞等，可能导致指甲下出血，形成淤血，从而使指甲凹陷。
4.疾病：某些疾病也可能引起脚趾甲凹陷，如银屑病、湿疹、扁平苔藓等皮肤病，以及心脏病、糖尿病等全身性疾病。
5.遗传因素：有些人可能天生就有指甲凹陷的问题，这可能与遗传有关。
如果发现脚趾甲中间凹进去，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。医生可能会建议进行以下检查：
1.真菌检查：如果怀疑是真菌感染，医生会取指甲屑进行真菌培养和镜检。
2.血液检查：检查是否有贫血、营养不良等情况。
3.其他检查：根据具体情况，医生可能还会建议进行皮肤检查、心电图等检查，以排除其他疾病。
治疗方法取决于病因。如果是营养不良，需要补充营养物质；如果是真菌感染，需要使用抗真菌药物治疗；如果是外伤导致，需要注意保护指甲，避免感染；如果是疾病引起，需要治疗原发病。此外，保持良好的生活习惯，如均衡饮食、避免长时间泡水、穿合适的鞋子等，也有助于指甲的健康。
需要注意的是，指甲凹陷可能是多种原因引起的，有些情况可能需要进一步检查和治疗。如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医。