生理期一般指女性的月经期，此时子宫内膜脱落，子宫腔表面会形成创面，且各个系统的免疫力下降。如果在生理期同房，可能会出现以下情况：
1.感染：月经期同房，男性生殖器可能会把细菌带入阴道内，经血是细菌等微生物的良好培养基，细菌极易滋生，沿子宫内膜内许多微小伤口和破裂的小血管扩散，感染子宫内膜，甚至可累及输卵管和盆腔器官，从而给女方带来不必要的麻烦，引发子宫内膜炎、盆腔炎等妇科疾病。
2.免疫性不孕：经期同房，由于精子在子宫内膜破损处和溢出的血细胞相遇，甚至进入血液，可诱发抗精子抗体的产生，从而导致免疫性不孕。
3.子宫内膜异位症：经期同房，月经血经输卵管倒流进入盆腔，随经血内流的子宫内膜碎屑有可能种植在卵巢上，形成内含咖啡色液体的囊肿，这种陈旧性的子宫内膜异位症会使患者出现渐进性加剧的痛经，还会扰乱正常的排卵和月经周期。
4.抗精子抗体：由于经期同房，部分精子及精液有可能通过微小裂口进入女性的血液循环，刺激免疫系统而形成抗精子抗体，从而导致免疫性不孕症。
如果在生理期已经同房，需要关注身体情况，如果出现发热、腹痛、阴道分泌物异常等不适症状，应及时就医，并告知医生实情，以便准确诊断和治疗。同时，建议在生理期避免同房，保持卫生，注意休息，避免劳累和剧烈运动。如果没有怀孕的计划，在生理期也要做好避孕措施，以免意外怀孕。