卵巢囊肿是否需要手术取决于多个因素，包括囊肿的大小、性质、症状以及患者的年龄和生育需求等。一般来说，以下情况可能需要考虑手术治疗：
1.囊肿较大：囊肿直径超过5厘米，尤其是在短期内迅速增大的情况下，手术可能是更合适的选择，以排除恶性肿瘤的可能。
2.症状明显：如果卵巢囊肿引起明显的腹痛、腹胀、性交痛、月经失调等症状，手术可以缓解这些症状并解决潜在的问题。
3.持续存在：经过一段时间的观察，囊肿持续存在或没有缩小的趋势，手术可能是更可靠的治疗方法。
4.怀疑恶变：如果超声或其他检查提示卵巢囊肿有恶变的迹象，如实性成分、血流丰富、乳头样突起等，手术是必要的，以确保彻底切除肿瘤。
对于3.5厘米的卵巢囊肿，是否需要手术需要综合考虑其他因素。医生可能会建议定期复查超声，观察囊肿的变化情况。如果囊肿没有明显增大或其他异常，可能会选择继续观察。但如果存在上述情况之一，手术可能是更合适的选择。
手术治疗卵巢囊肿的方法包括腹腔镜手术和开腹手术。腹腔镜手术是一种微创手术，通过小孔插入器械进行操作，具有创伤小、恢复快的优点。开腹手术则是通过腹部切口进行手术。医生会根据患者的具体情况选择最适合的手术方式。
需要注意的是，手术治疗卵巢囊肿是一种有效的方法，但也存在一定的风险，如出血、感染、损伤周围组织等。在决定手术之前，患者应与医生充分沟通，了解手术的风险和收益，并根据自己的情况做出明智的决策。
此外，无论是否进行手术治疗，患者都需要密切配合医生的随访和治疗。医生可能会建议定期复查超声、进行肿瘤标志物检测等，以监测囊肿的变化情况和排除其他潜在问题。
除手术治疗外，一些较小的卵巢囊肿可能也可以通过药物治疗、定期观察等方法进行处理。具体的治疗方案应根据个体情况制定，并在医生的指导下进行。
如果对卵巢囊肿的治疗有疑问或担忧，建议及时咨询妇科医生，以便获得更详细和个性化的建议。