卵巢囊肿并非都需要手术，一般来说直径大于5厘米的卵巢囊肿，手术干预的可能性较大，但也不是绝对，还需综合多方面因素判断。
生理性卵巢囊肿的情况
多数可自行消退： 部分卵巢囊肿是生理性的，比如卵泡囊肿和黄体囊肿，常见于月经周期的特定阶段。一般直径通常小于5厘米，这种情况不需要手术，通常在月经干净后复查，多数可自行消失。比如在月经中期形成的卵泡囊肿，很多会在下次月经来潮后缩小或消失。
病理性卵巢囊肿的手术指征
囊肿持续存在超3个月： 如果卵巢囊肿持续存在超过3个月，即使直径不足5厘米，也需要密切关注。因为持续存在的囊肿有恶变的可能，需要进一步评估。例如有些卵巢巧克力囊肿，即便初期直径不大，但会进行性发展，也可能需要手术干预。囊肿直径≥5厘米且怀疑恶变： 当卵巢囊肿直径达到或超过5厘米，同时通过检查怀疑有恶变倾向，如肿瘤标志物升高、超声提示囊肿内部结构复杂等情况时，通常建议手术治疗。比如超声显示囊肿内有乳头样结构，或者CA125等肿瘤标志物明显升高，这时候手术切除并进行病理检查很有必要。囊肿引起明显症状： 即使卵巢囊肿直径小于5厘米，但如果引起了明显的症状，如腹痛、腹胀、月经紊乱等，经保守治疗无效时，也需要考虑手术。比如卵巢囊肿扭转引起剧烈腹痛，这种情况不管囊肿大小，都需要急诊手术，否则可能导致卵巢缺血坏死。