三个月的宝宝睡觉老是摇头，可能是以下原因引起的：
1.正常的生理现象：宝宝的神经系统尚未完全发育成熟，可能会出现一些无意识的动作，包括摇头。这种情况通常是正常的，随着宝宝的成长会逐渐消失。
2.湿疹：如果宝宝头部有湿疹，可能会因为瘙痒而摇头。湿疹会导致皮肤发红、瘙痒，宝宝会通过摇头来缓解不适。
3.缺钙：宝宝缺钙可能会导致神经兴奋性增加，出现多汗、摇头、烦躁等症状。
4.环境因素：如果宝宝所处的环境过热、过冷或过于嘈杂，可能会影响宝宝的睡眠，导致其摇头。
5.耳部感染：耳部感染是导致宝宝摇头的常见原因之一。感染可能会引起耳部疼痛，宝宝会通过摇头来缓解不适。
针对宝宝睡觉老是摇头的情况，家长可以采取以下措施：
1.保持宝宝头部清洁，勤洗头，避免湿疹加重。
2.给宝宝提供舒适的睡眠环境，保持适宜的温度和湿度。
3.及时给宝宝补充维生素D和钙剂，促进钙的吸收。
4.注意观察宝宝的其他症状，如有无多汗、烦躁、夜惊等，如有异常，及时就医。
5.如果宝宝摇头伴有耳部症状，如哭闹、抓耳等，应及时带宝宝就医，进行耳部检查。
需要注意的是，以上内容仅供参考。如果宝宝的症状持续不缓解或伴有其他异常，建议及时就医，以便明确病因并进行针对性治疗。同时，家长在照顾宝宝时应细心观察，如有异常应及时就医。