头痛患者建议做核磁共振检查，磁共振主要用于检查颅内器质性病变引起的头痛。头痛是一种症状，可由多种疾病所引起。常见的疾病包括颅内器质性病变，也可能是由于原发性头痛疾病所引起。
引起头痛常见的颅内器质性病变包括颅脑肿瘤、中枢神经系统感染，主要包括脑炎和脑膜炎;也可能是由于脑血管疾病所引起，常见的疾病有脑出血和蛛网膜下腔出血;也可见于某些脑梗死的患者。
如果是由于器质性病变引起的头痛，主要是根据患者的病史、症状、体征，结合核磁共振检查以明确诊断。如果患者是原发性头痛疾病，常见的疾病包括偏头痛、紧张性头痛和丛集性头痛。
原发性头痛确切的病因尚不明确，主要是根据患者的症状体征，结合病史来进行诊断。