乙脑疫苗是预防流行性乙型脑炎的有效措施。乙脑疫苗注射后，少数人可能出现一过性发热反应，一般不超过2天，可自行缓解。通常这种发热与疫苗本身无关，而可能是由于个体差异或其他因素引起的。
然而，如果发热持续时间较长或体温较高（如39度），可能需要进一步观察和处理。以下是一些可能的原因和建议：
1.疫苗反应：乙脑疫苗注射后，身体可能会对疫苗中的成分产生反应，导致发热。这种发热通常是自限性的，不需要特殊处理，但需要密切观察孩子的情况。
2.感染：在接种疫苗后，孩子可能会因为免疫力暂时下降而感染其他病原体，如细菌、病毒或支原体等，从而引起发热。需要注意观察是否有其他症状，如咳嗽、流涕、喉咙痛等。
3.其他潜在问题：虽然乙脑疫苗是安全的，但在极少数情况下，可能会掩盖其他潜在的健康问题，如肺炎、脑炎等。如果孩子除了发热外，还有其他异常表现，应及时就医。
对于发热39度的情况，可以采取以下措施：
1.观察孩子的一般情况，如精神状态、呼吸、心率等。
2.给孩子多喝水，以补充因发热导致的水分流失。
3.可使用物理降温方法，如温水擦拭身体、使用退热贴等。但需注意避免过度降温。
4.如果孩子的体温持续不降或出现其他异常症状，应及时就医，医生可能会根据具体情况给予适当的治疗，如退烧药或进一步的检查。
需要强调的是，每个孩子的反应可能不同，如果对孩子的发热情况有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的意见。此外，在接种疫苗后，应密切观察孩子的身体状况，如有异常应及时就医。同时，遵循医生的建议，按时进行疫苗接种，以预防传染病的发生。