怀孕39天做B超不一定能看出来。一般来说，怀孕39天时，孕囊可能还太小，B超可能无法清晰显示。
通常，怀孕39天，也就是停经5周多，此时做B超检查，可能看到以下情况：
1.孕囊：B超可能会看到宫腔内有一个囊性结构，这可能是孕囊。孕囊的大小和形态会因个体差异而有所不同。
2.卵黄囊：在孕囊内，B超可能会看到一个小小的卵黄囊。卵黄囊是早期胚胎的一部分，它的存在可以提示孕囊的正常发育。
3.胚芽和胎心搏动：在怀孕6周左右，B超可能会看到胚芽和微弱的胎心搏动。但这需要经验丰富的医生进行仔细观察。
需要注意的是，B超检查的结果还受到多种因素的影响，如孕囊的位置、孕妇的腹部脂肪厚度等。有些孕妇可能需要等待一段时间，直到孕囊足够大，才能更清楚地看到。
此外，除了B超检查，医生还可能会结合其他检查结果，如血液HCG水平、孕酮水平等，来综合判断是否怀孕以及胚胎的发育情况。
如果对怀孕情况有任何疑问或担忧，建议及时咨询医生，医生会根据具体情况提供个性化的建议和指导。同时，在孕早期，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持良好的心态，有助于胚胎的健康发育。