三个月宝宝肚子老是咕噜咕噜响，可能是正常的肠鸣音，也可能是消化不良、肠道感染等原因引起的。可以通过调整饮食、腹部按摩、服用药物等方式进行治疗，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。具体分析如下：
1.正常肠鸣音：三个月的宝宝腹壁薄，肠鸣音可能会比较活跃，咕噜咕噜响可能是正常的肠鸣音。这种情况一般不需要特殊处理，注意观察宝宝的精神状态、食欲、大小便等情况即可。
2.消化不良：如果宝宝吃了过多的奶或其他食物，可能会导致消化不良，引起肠鸣音亢进、腹胀、腹痛等症状。可以通过调整饮食、腹部按摩、服用益生菌等方式进行治疗。调整饮食包括减少奶量或食物的摄入，顺时针按摩宝宝的腹部，以促进肠道蠕动，帮助消化。服用益生菌可以调节肠道菌群，改善消化不良的症状。
3.肠道感染：如果宝宝吃了被细菌、病毒等感染的食物或水，可能会引起肠道感染，导致肠鸣音亢进、腹泻、呕吐等症状。可以通过服用药物进行治疗，如蒙脱石散、双歧杆菌四联活菌片等。同时，要注意宝宝的饮食卫生，避免食用不洁食物和水。
4.其他：腹部受凉、乳糖不耐受等也可能会导致宝宝肚子咕噜咕噜响。腹部受凉可以通过热敷腹部、调整衣物等方式进行缓解。乳糖不耐受需要在医生的指导下调整饮食或服用药物进行治疗。
总之，三个月宝宝肚子老是咕噜咕噜响，需要根据具体情况进行分析和治疗。如果宝宝同时伴有其他症状，如腹泻、呕吐、发热等，建议及时就医，以免延误病情。在治疗期间，要注意宝宝的饮食卫生，避免食用过多的奶或其他食物，同时要注意腹部保暖。