怀孕40天时进行流产可能会对身体产生以下影响：
1.流产不全：若手术过程中未能完全清除子宫内的胚胎组织，可能导致流产不全，需要进行进一步的清宫手术。
2.出血：流产手术可能会导致子宫出血，出血量多且时间长可能会引发贫血及感染。
3.感染：手术过程中或术后护理不当，可能引起子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症。
4.月经失调：流产后可能会出现月经周期紊乱、经量异常等情况，一般需要一段时间才能恢复正常。
5.子宫内膜损伤：多次流产或刮宫可能会对子宫内膜造成损伤，影响日后受孕。
6.心理影响：流产对女性心理可能会产生一定的影响，如焦虑、抑郁等情绪。
需要注意的是，每个人的身体状况和手术过程都有所不同，这些影响并非一定会发生。在决定进行流产手术前，应充分了解手术的风险和后果，并在医生的指导下做出明智的选择。同时，术后应注意休息和护理，遵循医生的建议进行恢复，以减少对身体的伤害。如果出现异常症状，应及时就医。此外，对于未计划怀孕的女性，应做好避孕措施，避免多次流产对身体造成的不良影响。