怀孕40天选择药流或人流都可以，但需根据个人情况在医生的指导下进行选择，具体如下：
1.药流：指通过药物终止妊娠，适合怀孕49天内的女性。药流的优点是无需手术，对子宫的损伤较小，缺点是药流可能会出现药流不全，需要进行清宫手术。药流前需要进行B超检查，确定孕囊的位置和大小，同时需要进行血常规、白带常规等检查，排除药流的禁忌证。药流后需要注意观察阴道出血情况，如出血量多、出血时间长等，需要及时就医。
2.人流：指通过手术终止妊娠，包括负压吸引术和钳刮术。负压吸引术适合怀孕10周内的女性，钳刮术适合怀孕11-14周的女性。人流的优点是手术时间短，出血少，缺点是对子宫的损伤较大。人流前需要进行B超检查，确定孕囊的位置和大小，同时需要进行血常规、白带常规等检查，排除人流的禁忌证。人流后需要注意休息，避免劳累和剧烈运动，同时需要注意观察阴道出血情况，如出血量多、出血时间长等，需要及时就医。
需要注意的是，药流和人流都有一定的风险，可能会导致出血、感染、子宫穿孔等并发症。因此，在选择药流或人流时，需要慎重考虑，并在医生的指导下进行。同时，药流和人流后需要注意休息，加强营养，注意个人卫生，避免感染。如果出现异常情况，需要及时就医。