三个月宝宝睡觉摇头可能是正常的，也可能是由一些原因引起的。以下是一些可能的原因和建议：
1.正常现象：三个月的宝宝神经系统还没有完全发育成熟，容易受到外界刺激而出现不自主的运动，包括摇头。这种情况通常是正常的，随着宝宝的成长会逐渐消失。
2.皮肤问题：宝宝的头皮可能会出现湿疹、痱子等皮肤问题，导致瘙痒，从而引起摇头。保持宝宝头皮清洁，避免过度出汗，选择宽松、透气的衣物，可以缓解症状。
3.环境因素：过热、过冷或过于干燥的环境可能会让宝宝感到不适，导致摇头。调整室内温度和湿度，给宝宝提供舒适的睡眠环境。
4.缺钙：维生素D缺乏性佝偻病早期也可能表现为宝宝睡觉摇头，同时可能伴有多汗、夜惊、烦躁等症状。可以带宝宝去医院检查血钙、维生素D水平，以确定是否需要补充维生素D和钙剂。
5.耳部感染：宝宝的耳部感染时，可能会出现耳部疼痛，导致摇头。观察宝宝的耳部是否有红肿、分泌物等异常，如有需要及时就医。
6.其他：宝宝可能会因为鼻塞、消化不良等原因而感到不适，从而出现摇头。注意观察宝宝的其他表现，如有无流涕、咳嗽、呕吐、腹泻等症状。
如果宝宝睡觉摇头的情况持续不缓解或伴有其他异常症状，建议及时就医，以便明确原因并采取相应的措施。同时，家长也可以通过观察宝宝的日常表现，及时发现问题并采取适当的护理措施。