三个月宝宝睡觉摇头可能是正常的生理现象，也可能与维生素D缺乏、湿疹等有关。以下是一些建议：
1.观察宝宝的摇头是否伴有其他症状，如哭闹、烦躁、多汗、夜惊等。如果有这些症状，可能是维生素D缺乏或其他健康问题的表现，需要及时就医。
2.确保宝宝的睡眠环境舒适，温度适宜，床铺舒适。
3.给宝宝提供适当的安抚，如轻拍、拥抱等。
4.注意宝宝的头部清洁，定期清洗头发。
5.如果宝宝的摇头持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时就医，进行详细的身体检查和评估，以确定原因并给予适当的治疗。
需要注意的是，对于三个月的宝宝，他们的身体发育尚未完全，任何异常情况都应该引起重视。如果家长对宝宝的健康有任何疑虑，最好咨询医生的意见。同时，在照顾宝宝的过程中，要保持耐心和细心，密切关注宝宝的变化，确保他们的健康和安全。