伪膜性肠炎多发生在使用抗生素后，通常在用药后数天至2周内出现症状。其临床表现主要有以下几方面：
肠道相关表现
腹泻情况： 多数患者会出现腹泻，腹泻程度轻重不一，轻者每日腹泻数次，重者可达十余次甚至更多。粪便多为黄色水样便，有时可呈黏液样或脓血样。例如，有的患者每天腹泻5 - 10次左右。腹痛表现： 部分患者会有腹痛症状，腹痛程度可轻可重，一般为腹部隐痛或胀痛，也有的患者会出现较明显的腹痛。腹痛部位多在脐周。
全身症状
发热情况： 不少患者会出现发热，体温可轻度升高，一般在37.5℃ - 38.5℃左右，也有部分患者体温会更高。发热是因为肠道炎症引发的机体免疫反应。乏力表现： 患者往往会感觉全身乏力，没有精神，这是由于炎症导致身体处于应激状态，能量消耗增加等原因引起。
病情严重时的表现
中毒性巨结肠： 病情严重时可能出现中毒性巨结肠，此时患者会有腹胀明显加重、腹痛加剧等表现，还可能伴有高热、心率加快等全身中毒症状，这种情况比较危险，需要及时处理。电解质紊乱： 长期腹泻还可能导致电解质紊乱，比如出现低血钾，患者会有四肢无力、心律失常等表现；也可能出现低血钠等情况，表现为恶心、呕吐、精神萎靡等。