三个月的宝宝睡觉老是摇头，可能是正常的生理现象，也可能与疾病有关。以下是一些可能的原因：
1.正常的生理现象：
神经系统发育不完善：宝宝的神经系统还在发育中，内耳平衡系统也尚未成熟，可能会出现睡觉时摇头的现象。
出汗：宝宝新陈代谢旺盛，头部容易出汗，汗液刺激头皮会让宝宝感到不舒服，从而出现摇头的动作。
湿疹：如果宝宝头部有湿疹，也会因为瘙痒而摇头。
2.与疾病有关的原因：
维生素D缺乏性佝偻病：宝宝体内维生素D不足，会导致钙吸收不良，进而出现神经兴奋性增高的表现，如多汗、摇头、夜惊等。
中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会因耳部疼痛而出现摇头的现象。
其他：脑部疾病、过敏等也可能导致宝宝睡觉摇头。
如果宝宝只是偶尔摇头，精神状态良好，吃奶、睡眠正常，可能是正常的生理现象，家长不用过于担心。但如果宝宝经常摇头、哭闹不安、睡眠不实、多汗等，或者伴有其他异常表现，如发热、呕吐、抽搐等，应及时带宝宝就医，明确原因。
家长可以通过以下方法来改善宝宝睡觉摇头的情况：
1.保持舒适的睡眠环境：调整室内温度和湿度，给宝宝选择柔软、透气的床上用品。
2.及时清洁头部：保持宝宝头部清洁，勤洗头，避免湿疹的发生。
3.补充维生素D：按照医生的建议给宝宝补充维生素D，促进钙的吸收。
4.注意观察：密切观察宝宝的情况，如有异常及时就医。
总之，宝宝睡觉老是摇头可能是正常的，也可能是疾病的表现。家长需要仔细观察，必要时带宝宝就医，以便及时发现问题并采取相应的措施。