小肚子疼但是没来月经可能是怀孕、月经失调、妇科疾病等原因引起的，可以通过验孕、性激素六项、超声等检查来明确原因，并采取相应的治疗措施。具体分析如下：
1.怀孕：女性怀孕后，子宫会逐渐增大，可能会牵拉子宫韧带，引起小肚子疼痛。此外，怀孕后还可能出现恶心、呕吐、乏力等症状。如果有性生活，且月经推迟，应及时进行验孕检查，以确定是否怀孕。
2.月经失调：如果女性长期压力过大、作息不规律、过度节食等，可能会导致内分泌失调，从而引起月经失调，出现小肚子疼痛、月经推迟等症状。此外，子宫内膜异位症、多囊卵巢综合征等疾病也可能导致月经失调。患者应保持良好的生活习惯，避免熬夜，同时可在医生的指导下使用药物进行调理，如黄体酮、益母草等。
3.妇科疾病：盆腔炎、宫颈炎、子宫肌瘤等妇科疾病也可能导致小肚子疼痛，同时还可能伴有白带异常、阴道出血等症状。患者可及时就医，进行相关检查，如白带常规、超声等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。
患者在治疗期间需要注意个人卫生，保持外阴清洁，同时可适当食用红枣、桂圆等食物，避免食用辛辣、生冷等刺激性食物。