咳嗽时腰两边疼，可能与以下原因有关。
1.腹部肌肉紧张：咳嗽时腹部肌肉会收缩，若长期、剧烈咳嗽，可能导致腹部肌肉疲劳或拉伤，从而引起腰两边疼。
2.腰椎病变：腰椎间盘突出、腰椎管狭窄等腰椎病变，可能在咳嗽时刺激神经，引起腰两边疼。
3.肾脏疾病：如肾炎、肾结石等，也可能导致腰部疼痛，同时可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
4.其他：胸膜炎、肺炎等疾病也可能引起咳嗽和腰部疼痛。
如果咳嗽时腰两边疼的症状持续不缓解或加重，建议及时就医，进行相关检查，如腰椎X线、CT、腹部超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在咳嗽时应注意保暖，避免腰部受凉，也可以通过热敷、按摩等方式缓解疼痛。