怀孕三个月头疼可能是正常的孕期反应，但也可能是其他问题引起的。以下是一些可能的原因和建议：
1.激素变化：怀孕后，女性体内的激素水平会发生变化，这可能导致头疼。此外，激素变化还可能引起其他不适症状，如乳房胀痛、恶心、呕吐等。
2.睡眠不足：怀孕期间，女性的身体需要更多的休息，如果睡眠不足，可能会导致头疼。
3.营养不良：怀孕期间，女性需要摄入足够的营养物质，如果营养不良，可能会导致头疼。
4.血压升高：怀孕期间，女性的血压可能会升高，如果血压升高，可能会导致头疼。
5.其他因素：怀孕期间，女性的身体会发生很多变化，其他因素也可能导致头疼，如贫血、低血糖、颈椎病等。
如果怀孕三个月头疼，建议采取以下措施：
1.休息：尽量多休息，避免过度劳累。
2.调整姿势：改变头部的位置，如躺下、坐直或站立，以缓解头疼。
3.放松：进行放松练习，如深呼吸、冥想、瑜伽等。
4.按摩：轻轻按摩头部和颈部，以缓解紧张和疼痛。
5.饮食调整：保持均衡的饮食，避免食用刺激性食物和饮料，如咖啡、茶、巧克力等。
6.就医：如果头疼严重、持续时间长或伴有其他症状，如视力模糊、恶心、呕吐等，应及时就医。医生可能会进行详细的检查，以确定头疼的原因，并给予相应的治疗。
需要注意的是，怀孕期间应避免自行用药，尤其是在怀孕前三个月。如果需要用药，应在医生的指导下使用。此外，怀孕期间应定期进行产前检查，以确保胎儿的健康。