手足口病的传染源主要是患者和隐性感染者。据研究，在手足口病流行期间，隐性感染者的数量可能是患者数量的数倍。
患者是重要传染源
发病期患者： 处于发病期的手足口病患者，其唾液、疱疹液和粪便中都含有大量的肠道病毒，能够通过接触、飞沫等途径传播给他人。例如，患者咳嗽、打喷嚏产生的飞沫中就带有病毒，健康人吸入后可能被感染。疱疹破溃期患者： 当患者的疱疹破溃时，病毒更容易从破溃处溢出，污染周围环境，增加了传播风险。
隐性感染者也是传染源
无症状携带病毒者： 有些人感染了肠道病毒后并没有出现明显的手足口病症状，但体内却携带病毒，同样具有传染性。这类隐性感染者可能在不知不觉中就将病毒传播给他人，尤其是在幼儿园、学校等人员密集场所，很容易造成病毒的传播扩散。病毒持续排毒者： 部分隐性感染者可能会持续排出病毒一段时间，虽然自身没有发病，但仍然能够成为传染源，对周围人群构成威胁。
传播途径与传染源的关联
通过密切接触传播： 与传染源直接接触，如接触患者的玩具、餐具、毛巾等被病毒污染的物品，或者与患者握手、拥抱等，都可能感染病毒。比如，在幼儿园里，如果一个孩子是手足口病患者，他使用过的玩具没有及时消毒，其他孩子接触后就有可能被传染。通过飞沫传播： 传染源咳嗽、打喷嚏产生的飞沫中含有病毒，健康人吸入后可能被感染。在空气不流通的教室、家庭等环境中，这种飞沫传播的风险会更高。