3个月宝宝咳嗽、鼻塞，可采取以下方式处理：
1.清理鼻腔：使用生理性海盐水滴鼻或喷鼻，软化或稀释鼻涕后，使用吸鼻器吸出分泌物，有助于缓解鼻塞。
2.调整环境：保持室内空气湿润，适当提高室内温度，可缓解咳嗽和鼻塞症状。
3.改变体位：将宝宝竖着抱起来或侧卧，有助于缓解咳嗽和鼻塞。
4.拍背：空心掌由下往上、由外向内给宝宝拍背，促进痰液排出。
5.补充水分：适当增加宝宝的液体摄入，有助于缓解咳嗽和鼻塞。
6.就医：如果宝宝咳嗽、鼻塞症状持续不缓解或出现发热、呼吸急促等异常，应及时就医，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
需要注意的是，3个月以下的宝宝出现咳嗽、鼻塞症状，建议及时就医，以免病情加重。同时，在就医过程中，应如实告知医生宝宝的症状、持续时间、喂养情况等，以便医生进行准确的诊断和治疗。