精神分裂症的病因目前尚未完全明确，但研究发现多种因素相互作用可能导致其发病。一般认为遗传因素在其中占比较重要的地位，据统计，如果直系亲属中有患精神分裂症的人，那么亲属患病风险比普通人群高10倍左右。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 大量的遗传学研究表明，精神分裂症具有明显的家族聚集性。如果父母一方患有精神分裂症，子女患病的概率约为10% - 12%；而父母双方都患病时，子女患病概率可高达40%左右。这是因为遗传基因中存在一些与精神分裂症发病相关的易感基因，这些基因会增加个体患该病的易感性。基因与环境交互作用： 即使携带了相关的易感基因，也不一定就会发病，环境因素也起到关键作用。比如在成长过程中经历重大生活事件，像严重的精神创伤、长期处于压力过大的环境等，就可能触发基因的表达，导致精神分裂症的发生。
大脑结构和功能异常方面
大脑结构改变： 研究发现，精神分裂症患者的大脑在结构上存在一些异常。例如，脑室可能会扩大，大脑皮层某些区域的灰质体积会减少。通过磁共振成像（MRI）等检查可以观察到这些变化。而且，患者大脑中的海马体也可能出现体积缩小的情况，海马体与记忆、情绪调节等功能密切相关，其异常会影响这些功能的正常运作。神经递质失衡： 神经递质在大脑的神经信号传递中起着重要作用。其中多巴胺系统被认为与精神分裂症的发病关系密切。多巴胺功能亢进可能会导致精神分裂症的阳性症状，如幻觉、妄想等；而5 - 羟色胺等其他神经递质的失衡也可能参与了该病的发病过程，影响患者的情感、认知等方面的功能。
环境因素方面
心理社会因素： 不良的心理社会环境是精神分裂症发病的重要诱因之一。长期处于家庭不和睦、经济状况差、生活节奏紧张且缺乏社会支持的环境中，会使个体患精神分裂症的风险增加。例如，一些经历过重大生活变故，如亲人离世、婚姻破裂等的人，比普通人更容易患上精神分裂症。孕期和围产期因素： 母亲在孕期的一些不良状况也可能影响胎儿的大脑发育，增加后代患精神分裂症的风险。比如孕期感染病毒、受到辐射、营养不良等，都可能干扰胎儿神经系统的正常发育，为日后患精神分裂症埋下隐患。另外，围产期出现并发症，如早产、新生儿窒息等，也与精神分裂症的发病有一定关联。