孕39周宫缩频繁但肚子不痛，可能是生理性宫缩，也可能是其他原因引起，需要及时就医，以明确原因。
孕39周时，子宫比较敏感，容易出现不规律宫缩，其特点是宫缩持续时间短、不恒定、强度弱，常在夜间出现，清晨消失，这种宫缩不会引起宫颈管消失和宫颈口扩张，属于生理性宫缩，一般不需要特殊处理。
但如果宫缩逐渐增强，持续时间延长，间歇时间缩短，或伴有阴道见红、破水等症状，可能是先兆临产或临产的表现，需要及时就医。医生会进行详细的产前检查，评估宫缩的情况，以及胎儿的情况，并根据具体情况决定处理方法。
此外，一些其他情况也可能导致宫缩频繁，如前置胎盘、胎盘早剥、早产等。这些情况可能会对孕妇和胎儿的健康造成威胁，需要及时就医，进行相应的治疗。
总之，孕39周宫缩频繁但肚子不痛时，需要密切观察宫缩的情况，并及时就医，以确保孕妇和胎儿的安全。