睡觉起来眼睛疼可能由以下原因引起。
1.用眼过度：长时间使用电子设备、阅读、写作等，导致眼睛疲劳和干涩。
2.睡眠不足：睡眠质量差或睡眠时间不足，眼睛没有得到充分的休息。
3.眼部感染：如结膜炎、角膜炎等，可能导致眼睛红肿、疼痛、分泌物增多。
4.过敏：对空气中的过敏原如花粉、灰尘等过敏，可能引起眼睛瘙痒、疼痛、红肿。
5.眼部损伤：睡觉时不小心压迫或碰撞到眼睛，可能导致眼部组织损伤。
6.环境因素：干燥、多风、烟尘等环境，可能刺激眼睛引起疼痛。
7.疾病因素：某些疾病如青光眼、虹膜炎等也可能导致眼睛疼痛。
如果眼睛疼痛持续时间较长、症状严重或伴有其他不适，如视力下降、头痛等，应及时就医，进行详细的眼部检查，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持良好的用眼习惯，保证充足的睡眠，避免长时间用眼，保持眼部清洁，避免感染。如果是过敏引起的，应尽量避免接触过敏原。