怀孕三个月时肚子隐隐作痛可能是正常的，但也可能提示存在一些问题。以下是一些可能的原因：
1.子宫增大：怀孕后，子宫会逐渐增大，以适应胎儿的生长。这个过程中，子宫可能会出现轻微的牵拉感或隐痛。
2.韧带拉伸：子宫周围的韧带也会随着子宫的增大而被拉伸，可能引起腹部隐痛。
3.消化问题：怀孕后，激素水平的变化可能影响消化系统，导致消化不良、胃胀、胃痛等不适。
4.其他：如先兆流产、宫外孕、子宫肌瘤等情况，也可能引起腹痛。
需要注意的是，虽然有些情况下肚子隐痛是正常的，但如果疼痛加剧、伴有阴道流血、发热等异常症状，应立即就医，以排除潜在的问题。
对于怀孕三个月肚子隐隐作痛的情况，建议采取以下措施：
1.休息：避免过度劳累，尽量保证充足的睡眠。
2.调整饮食：避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，多吃易消化、营养丰富的食物。
3.注意保暖：避免腹部受凉，尤其是在空调房间里。
4.放松心情：紧张和焦虑情绪可能加重腹痛，保持心情放松。
5.按时产检：按照医生的建议进行产前检查，及时了解胎儿的发育情况。
如果疼痛持续不缓解或出现其他异常症状，应及时就医，进行详细的检查，以确保孕妇和胎儿的健康。同时，在怀孕期间，应注意个人卫生，避免性生活，避免剧烈运动，如有任何不适，应及时告知医生。