宝宝肛周脓肿形成的原因主要与以下几方面有关。一般来说，宝宝肛周脓肿多是由细菌感染等因素导致，比如大约50%以上的肛周脓肿是因肛腺感染引起。
一、肛腺感染相关
肛腺开口位置： 宝宝的肛腺开口于肛管直肠交界处的肛窦处，而肛窦又容易存留粪便等物质，当粪便等异物堵塞肛窦时，就容易引发肛腺感染。一旦肛腺感染，炎症就会向周围组织蔓延，进而形成肛周脓肿。肛腺发育特点： 宝宝的肛腺相对较发达，而且肛腺导管比较直、短，这使得细菌更容易侵入肛腺并引发感染。比如在宝宝排便后，如果清洁不彻底，粪便残留更容易导致肛窦感染，从而诱发肛腺感染，最终形成肛周脓肿。
二、局部皮肤卫生问题
尿布更换不及时： 宝宝如果长时间使用尿布，而且没有及时更换，尿液和粪便会持续刺激宝宝的肛周皮肤。据统计，约有30%以上的肛周脓肿患儿是因为尿布更换不及时，导致肛周皮肤处于潮湿、不清洁的环境中，细菌容易滋生，引发感染形成脓肿。粪便刺激： 宝宝的粪便中含有多种细菌，当粪便污染肛周皮肤后，如果不能及时清理，这些细菌就会在肛周皮肤繁殖，破坏皮肤的屏障功能，使得细菌更容易侵入皮下组织，引发脓肿。例如，宝宝腹泻时，粪便频繁刺激肛周，就增加了肛周脓肿的发生风险。
三、免疫力因素
宝宝自身免疫力较低： 宝宝的免疫系统还处于发育不完善的阶段，相对成人来说免疫力较低。一般6个月 - 2岁的宝宝免疫力更为薄弱，这个阶段宝宝发生肛周脓肿的概率相对较高。因为免疫力低下，宝宝身体对细菌等病原体的抵抗力较弱，一旦有细菌入侵肛周组织，就更容易发生感染并形成脓肿。先天免疫缺陷： 虽然比较少见，但个别宝宝可能存在先天免疫缺陷问题，这会使宝宝更容易受到细菌等感染，从而增加肛周脓肿的发生几率。这类宝宝需要特别关注肛周卫生等情况，一旦发现肛周有异常要及时就医。