三个月宝宝干咳干呕，可能是由多种原因引起的，需要引起重视并及时就医。以下是一些可能的原因：
1.呼吸道感染：如感冒、喉炎等，会导致宝宝咳嗽和干呕。
2.过敏：宝宝对空气中的过敏原（如花粉、尘螨等）过敏，可能会引起咳嗽和干呕。
3.胃食管反流：由于宝宝的胃容量较小，且胃食管括约肌尚未完全发育成熟，胃酸容易反流到食管，引起咳嗽和干呕。
4.干燥空气：空气干燥会刺激宝宝的呼吸道，引起咳嗽和干呕。
5.其他：如吸入异物、百日咳等也可能导致宝宝干咳干呕。
需要注意的是，三个月的宝宝咳嗽和干呕可能会引起呛咳、呼吸困难等问题，甚至影响宝宝的生长发育。因此，如果宝宝出现干咳干呕的症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，家长也可以采取以下措施来缓解宝宝的不适：
1.保持室内空气湿润，可以使用加湿器等设备。
2.给宝宝适量的水，保持口腔湿润。
3.避免宝宝接触过敏原。
4.喂奶后及时拍嗝，帮助宝宝排出胃内气体。
5.注意宝宝的保暖，避免着凉。
总之，三个月宝宝干咳干呕需要引起家长的重视，及时就医并采取适当的措施，以保障宝宝的健康。