三个月宝宝嗓子有痰，可能是以下原因引起的：
1.呼吸道感染：三个月的宝宝免疫系统尚未完全发育，容易受到病毒或细菌感染，导致呼吸道炎症和分泌物增多。
2.过敏：宝宝可能对空气中的过敏原过敏，如尘螨、花粉等，引起呼吸道过敏反应，导致嗓子有痰。
3.鼻腔分泌物倒流：宝宝的鼻腔较小，容易堵塞，分泌物可能倒流至嗓子，引起咳嗽和咳痰。
4.喉软化症：这是一种先天性疾病，由于喉部结构发育不完善，导致吸气时喉部塌陷，引起呼噜声和痰鸣音。
5.其他：如食管反流、气管食管瘘等。
针对宝宝嗓子有痰的情况，可以采取以下措施：
1.保持室内空气湿润，可以使用加湿器增加空气湿度。
2.给宝宝适量喂水，有助于稀释痰液。
3.经常变换宝宝体位，有助于痰液咳出。
4.轻拍宝宝背部，从下往上，有助于促进痰液排出。
5.如果宝宝咳嗽严重或伴有其他症状，如呼吸急促、发热等，应及时就医。医生可能会根据具体情况进行诊断，并给予相应的治疗，如药物治疗、雾化治疗等。
需要注意的是，不要自行给宝宝使用止咳药或祛痰药，以免影响宝宝的病情。同时，如果宝宝的症状持续不缓解或加重，应及时就医，以便得到及时的治疗。