怀孕45天B超未见孕囊可能是以下原因导致的。
实际受孕时间晚：受精卵着床时间较晚，孕囊可能还未到达子宫，或者孕囊较小，B超无法检测到。
宫外孕：受精卵在子宫以外的部位着床，如输卵管、卵巢等，B超也无法在子宫内看到孕囊。
胚胎发育不良：孕囊内没有胎芽、胎心搏动，或者孕囊形态不规则，提示胚胎可能停止发育。
其他：子宫肌瘤、子宫畸形等也可能影响孕囊的显示。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要结合临床症状、HCG水平、孕酮等检查结果综合判断。如果怀孕45天B超未见孕囊，医生会建议进行进一步的检查，如血HCG、孕酮、阴道超声等，以明确孕囊的位置和发育情况。如果确诊宫外孕，需要及时治疗，以免发生危险。如果孕囊发育不良，医生可能会建议终止妊娠。如果是其他原因导致的未见孕囊，医生会根据具体情况给出相应的处理建议。
在等待检查结果的过程中，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活。如果出现阴道流血、腹痛等异常情况，应及时就医。同时，孕妇应保持良好的心态，积极配合医生的治疗。