三个月宝宝老是摇头，可能是以下原因引起：
1.正常的生理现象：宝宝的前庭功能还未发育完善，摇头可能是在自我安抚。这种情况通常会随着宝宝的成长逐渐消失。
2.皮肤问题：宝宝头部出汗多，汗液刺激皮肤，会让宝宝感到瘙痒，从而出现摇头的现象。此外，如果宝宝头部有湿疹、痱子等，也会引起瘙痒，导致宝宝摇头。
3.耳朵问题：宝宝的耳朵里有耳屎，或者耳朵进水、感染等，都可能引起耳部不适，导致宝宝摇头。
4.缺钙：宝宝缺钙会导致头部多汗，烦躁不安，从而出现摇头的现象。
5.其他：宝宝如果患有维生素D缺乏性佝偻病、头皮瘙痒等，也会出现摇头的症状。
如果宝宝摇头的同时，还伴有哭闹、抓耳挠腮、睡眠不安等症状，或者摇头的情况比较严重，建议及时带宝宝就医，明确原因，以便采取相应的措施。