宝宝三个月睡觉老是摇头，可能是以下原因引起：
1.正常生理现象：宝宝的前庭功能尚未发育成熟，会出现摇头的现象，这是一种正常的生理反应。随着宝宝的成长，这种现象会逐渐消失。
2.湿疹：如果宝宝头部有湿疹，会因为瘙痒而出现摇头的情况。此时，宝宝可能会用手搔抓头部，导致头部皮肤破损。家长可以检查宝宝的头部是否有湿疹，并及时就医。
3.缺钙：如果宝宝体内缺钙，会导致神经兴奋性增加，从而出现多汗、摇头、烦躁等症状。家长可以带宝宝去医院检查微量元素，以确定是否缺钙。如果缺钙，需要在医生的指导下补充钙剂和维生素D。
4.头皮瘙痒：宝宝的头皮上可能会有一些污垢，这些污垢会刺激头皮，导致宝宝感到瘙痒，从而出现摇头的情况。家长可以用温水轻轻擦拭宝宝的头皮，去除污垢。
5.中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会出现耳部疼痛、瘙痒等症状，从而导致宝宝摇头。家长可以观察宝宝的耳部是否有红肿、分泌物等异常情况，如果有，需要及时就医。
6.其他：宝宝在睡眠过程中，周围环境的温度过高、过低，或者噪音过大等，也可能会导致宝宝感到不适，从而出现摇头的情况。家长可以调整宝宝的睡眠环境，保持适宜的温度和安静。
总之，如果宝宝三个月睡觉老是摇头，家长需要注意观察宝宝的情况，如果症状持续不缓解或伴有其他异常症状，需要及时就医，以确定原因，并采取相应的治疗措施。